Encontros de Biomatemática
Statistical test for a hidden Markov model for nucleotide distribution in bacterial DNA
Prof. Dr. Marcelo Sobottka MTM/UFSC
Resumo:
In this work, we present parameter estimators for a hidden-Markov based model for the distributional structure of nucleotides in bacterial DNA sequences. Such model supposes that the gross structure of bacterial DNA sequences can be derived from uniformly distributed mutations of some primitive genome which is constructed following a ten-parameter Markov process [1].
The proposed estimators can be used to construct a statistical test which indicates if a given DNA sequence can be simulated by the model.
This is a joint work with A. G. Hart (Centro de Modelamiento Matemático, Universidad de Chile) and M. Weber Mendonça (Universidade Federal de Santa Catarina). M. Sobottka was supported by CNPq-Brazil grant 455399/2011-5 and by CAPES-Brazil Fellowship.
[1] M. Sobottka and A. G. Hart. A model capturing novel strand symmetries in bacterial DNA. Biochemical and Biophysical Research Communications 410, 4, 823–828 (2011).
Dia – Hora: 9/06/2016 – 15:30h
Local: sala 302 do Departamento de Matemática UFSC
E. Krukoski
Tags:
bacterialBiomatemáticaDNAMarkov modelnucleotide
Colóquio de Matemática
Some Examples of Universality in Dynamics
Prof. Udayan Babubhai Darji (University of Louisville – USA)
Resumo:
In this talk we discuss two types of dynamical systems. Once concerns the dynamics of linear map on separable Banach spaces and the other concerns dynamical systems on the Cantor set. It is well-known that dynamics of compact metric metric space can be captured by the dynamics of the Cantor space. More precisely, if (X,f) is a dynamical systems with X a compact metric space and f continuous, then (X,f) is a factor of some (C,g) where C is the Cantor space and g is continuous self-map of C. Hence, in some sense Cantor set is universal for dynamics of compact metric spaces. The type of questions we discuss concerns given a large class of dynamical systems, can we find one “super” or “universal” dynamical systems such that every system in the given class is a factor of this “universal” dynamical system?
This is joint work with Etienne Matheron. The results of this talk will appear in Proc of the AMS
Dia – Hora: 10/06/2016 – 14:00h
Local: Auditório do Departamento de Matemática (Sala 007) – UFSC
Cartaz
E. Krukoski
Tags:
Dynamical SystemsUniversality
Seminário de Matemática Aplicada
Teoremas de suporte para certas generalizações das transformadas de Radon
Antônio Sá Barreto – Departamento de Matemática, Purdue University (EUA
Resumo:
Local: Sala 202, Departamento de Matemática, segundo andar (notem a sala atípica)
Horário: 14:00-14:50
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E. Krukoski
Seminário em Análise Convexa e Otimização
Um método de gradiente projetado para otimização sobre matrizes de densidade
Prof. Dr. Douglas S. Gonçalves – MTM/UFSC
Resumo: Um ensemble de estados quânticos pode ser descrito por uma matriz Hermitiana, positiva semidefinida e de traço um, chamada matriz de densidade. Logo, é de interesse o estudo de métodos para minimizar uma certa função (energia, entropia, etc) sobre o conjunto de matrizes de densidade. Apresentamos um método de gradiente projetado que explora a geometria do conjunto viável: resultado da intersecção do cone das matrizes positivas semidefinidas com o hiperplano definido pela restrição do traço unitário. Resultados numéricos em problemas de tomografia de estados quânticos atestam a efetividade do método proposto quando comparado com métodos clássicos da literatura baseados em iteração de ponto fixo e programação semidefinida.
Data – Hora: Quarta-feira, 8 de junho, 10h30
Local: Sala 202 do Departamento de Matemática – UFSC
E. Krukoski
Tags:
Análise Convexamétodo de gradienteotimização
Seminário de Equações Diferenciais
Sistemas Dinâmicos Impulsivos
Prof. Dr. Matheus Cheque Bortolan – MTM/UFSC
Resumo: Nesta palestra vamos fazer uma introdução aos sistemas impulsivos e resultados mais recentes desta teoria, bem como abordar futuros temas de pesquisa.
Data: 08/06/2016 (quarta-feira)
Local / Hora: Sala 302 do Departamento de Matemática / 15:30h
E. Krukoski